پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی )SNP )و روشهای ژنوتایپینگ آن

چکیده مقاله

(SNPs (Polymorphisms Nucleotide Singleیا چند شکلی های تک نوکلئوتیدی، تفاوت یافت شده دریک نوکلئوتید نسبت به موقعیت مشابه آن در توالی DNA است. پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی )SNP)تغییرات وتنوع های توالی طبیعی با دانسیته باال در ژنوم ها هستند.SNPها بعنوان یک منبع ژنتیکی عمده ازتغییرفنوتیپی درون یک گونه در نظر گرفته می شوند وبعنوان مارکر ژنتیکی مهم وخوبی به حساب می آیند. به طور کلی SNP ها به دو دسته تقسیم می شوند: SNP هایی که در مناطق کد کننده رخ می دهند و وجود دارند و SNPهایی که در مناطق غیر کد کننده رخ می دهند . برای کشف SNPدر مناطق ژنومی منتخب یک غربالگری اولیه قبل ازتعیین توالی نیاز است. برای ژنوتایپینگ SNPها دو استراتژی تبعیض اللی )Strategies Discrimination Allele)و تشخیص الل ) MethodS (Detection Alleleوجود دارد . استراتژی های تبعیض الل با واکنش های بیوشیمیایی اختصاصی آلل انجام می شود و شامل چهار روش عمومی گسترش)توسعه ی( پرایمری)extension Primer،)هیبریداسیون )Hybridization،)روش اتصال )Ligation، )شکاف آنریمی )cleavage enzymatic )می باشد. از جمله روشهای تشخیص الل می توان به تشخیص مبتنی بر mass-اسپکت ،تشخیص مبتنی بر سیگنال فلورسانس و کمیلو مینسنس اشاره کرد. SNPها کاربردهای فراوانی از جمله بعنوان نشانگر ملکولی در تحقیقات ژنتیکی و اصالح ، بعنوان نشانگر ملکولی در مطالعات ژنتیکی بیماریها و ژنومیکس دارو، در نقشه یابی ژنتیکی ،انتخاب به کمک نشانگر و ..... دارند.

دریافت لینک دانلود مقاله